Puisque l'analyse microbiologique est habituellement entreprise loin de la piscine et elle prendra normalement au moins 24 heures avant que tous les résultats sont disponibles, l'hygiène du point de vue microbiologique est intuitive - c.-à-d. - la désinfection de la piscine et le pH n'ont pas échoué. Si ce dernier est demeuré constamment au-dessus des valeurs minimum admises, dans ce cas, on peut supposer (à court terme) que la qualité microbiologique de l'eau est satisfaisante et sûre. Ceci ne signifie pas cependant, de s'affranchir d'entreprendre un essai microbiologique réel régulièrement. N'importe quelle piscine commerciale devrait avoir un essai microbiologique régulier à une fréquence appropriée entre 4 à 26 fois par an. Souvent, un comptage sur plaque ou un TVC simple sera suffisant, avec davantage de recherche et un essai plus spécifique si ces essais initiaux montrent une présence significative de bactéries.